Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCS1P62166 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCS1P62166 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCS1P62166 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCS1P62166 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCS1P62166 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NCS1P62166 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCS1P62166 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCS1P62166 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCS1P62166 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCS1P62166 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCS1P62166 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCS1P62166 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCS1P62166 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCS1P62166 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCS1P62166 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCS1P62166 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCS1P62166 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCS1P62166 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NCS1P62166 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCS1P62166 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCS1P62166 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCS1P62166 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NCS1P62166 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCS1P62166 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCS1P62166 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCS1P62166 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCS1P62166 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCS1P62166 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCS1P62166 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCS1P62166 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCS1P62166 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCS1P62166 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCS1P62166 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCS1P62166 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCS1P62166 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCS1P62166 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCS1P62166 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCS1P62166 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCS1P62166 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCS1P62166 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCS1P62166 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCS1P62166 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCS1P62166 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCS1P62166 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCS1P62166 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCS1P62166 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCS1P62166 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCS1P62166 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCS1P62166 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCS1P62166 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCS1P62166 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NCS1P62166 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCS1P62166 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCS1P62166 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCS1P62166 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCS1P62166 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCS1P62166 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCS1P62166 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCS1P62166 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCS1P62166 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCS1P62166 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCS1P62166 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NCS1P62166 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCS1P62166 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCS1P62166 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCS1P62166 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCS1P62166 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCS1P62166 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCS1P62166 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCS1P62166 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCS1P62166 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCS1P62166 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCS1P62166 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCS1P62166 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NCS1P62166 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCS1P62166 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCS1P62166 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCS1P62166 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCS1P62166 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCS1P62166 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCS1P62166 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCS1P62166 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCS1P62166 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCS1P62166 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCS1P62166 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCS1P62166 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCS1P62166 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCS1P62166 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCS1P62166 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCS1P62166 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCS1P62166 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCS1P62166 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
NCS1P62166 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCS1P62166 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCS1P62166 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCS1P62166 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCS1P62166 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NCS1P62166 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NCS1P62166 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms