Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2fP61219 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Polr2fP61219 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr2fP61219 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Polr2fP61219 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms