Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRP54P61011 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP54P61011 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP54P61011 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP54P61011 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP54P61011 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP54P61011 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP54P61011 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP54P61011 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP54P61011 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRP54P61011 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP54P61011 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP54P61011 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP54P61011 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRP54P61011 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRP54P61011 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRP54P61011 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRP54P61011 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRP54P61011 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRP54P61011 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRP54P61011 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRP54P61011 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRP54P61011 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRP54P61011 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRP54P61011 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRP54P61011 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRP54P61011 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRP54P61011 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRP54P61011 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRP54P61011 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRP54P61011 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SRP54P61011 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRP54P61011 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRP54P61011 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRP54P61011 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRP54P61011 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRP54P61011 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRP54P61011 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRP54P61011 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRP54P61011 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRP54P61011 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRP54P61011 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRP54P61011 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRP54P61011 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRP54P61011 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRP54P61011 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRP54P61011 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRP54P61011 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRP54P61011 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRP54P61011 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SRP54P61011 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRP54P61011 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRP54P61011 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRP54P61011 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRP54P61011 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRP54P61011 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRP54P61011 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRP54P61011 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRP54P61011 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRP54P61011 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRP54P61011 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SRP54P61011 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRP54P61011 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRP54P61011 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRP54P61011 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRP54P61011 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRP54P61011 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRP54P61011 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRP54P61011 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRP54P61011 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRP54P61011 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRP54P61011 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRP54P61011 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRP54P61011 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRP54P61011 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRP54P61011 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRP54P61011 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRP54P61011 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRP54P61011 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRP54P61011 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRP54P61011 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRP54P61011 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRP54P61011 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRP54P61011 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRP54P61011 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRP54P61011 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRP54P61011 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRP54P61011 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRP54P61011 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRP54P61011 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRP54P61011 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRP54P61011 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRP54P61011 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRP54P61011 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRP54P61011 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRP54P61011 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRP54P61011 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRP54P61011 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRP54P61011 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRP54P61011 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms