Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVFC1-1P60608 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVFC1-1P60608 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms