Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Eif3eP60229 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eif3eP60229 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif3eP60229 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms