Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCCD1P59942 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCCD1P59942 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCCD1P59942 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCCD1P59942 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCCD1P59942 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCCD1P59942 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MCCD1P59942 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCCD1P59942 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCCD1P59942 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MCCD1P59942 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MCCD1P59942 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCCD1P59942 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCCD1P59942 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCCD1P59942 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCCD1P59942 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MCCD1P59942 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCCD1P59942 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCCD1P59942 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCCD1P59942 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MCCD1P59942 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCCD1P59942 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCCD1P59942 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MCCD1P59942 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCCD1P59942 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCCD1P59942 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCCD1P59942 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCCD1P59942 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCCD1P59942 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCCD1P59942 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCCD1P59942 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCCD1P59942 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MCCD1P59942 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCCD1P59942 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCCD1P59942 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCCD1P59942 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCCD1P59942 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms