Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Nphp4P59240 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Nphp4P59240 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Nphp4P59240 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Nphp4P59240 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Nphp4P59240 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Nphp4P59240 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Nphp4P59240 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Nphp4P59240 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Nphp4P59240 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Nphp4P59240 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Nphp4P59240 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Nphp4P59240 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Nphp4P59240 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Nphp4P59240 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Nphp4P59240 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Nphp4P59240 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Nphp4P59240 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Nphp4P59240 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Nphp4P59240 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Nphp4P59240 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Nphp4P59240 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Nphp4P59240 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Nphp4P59240 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Nphp4P59240 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Nphp4P59240 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Nphp4P59240 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Nphp4P59240 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Nphp4P59240 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Nphp4P59240 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Nphp4P59240 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Nphp4P59240 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Nphp4P59240 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Nphp4P59240 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Nphp4P59240 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Nphp4P59240 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nphp4P59240 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Nphp4P59240 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Nphp4P59240 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Nphp4P59240 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Nphp4P59240 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Nphp4P59240 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Nphp4P59240 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Nphp4P59240 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Nphp4P59240 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Nphp4P59240 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Nphp4P59240 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Nphp4P59240 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nphp4P59240 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nphp4P59240 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Nphp4P59240 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Nphp4P59240 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Nphp4P59240 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Nphp4P59240 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nphp4P59240 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Nphp4P59240 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nphp4P59240 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nphp4P59240 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nphp4P59240 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nphp4P59240 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nphp4P59240 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nphp4P59240 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nphp4P59240 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nphp4P59240 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nphp4P59240 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Nphp4P59240 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Nphp4P59240 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Nphp4P59240 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nphp4P59240 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nphp4P59240 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nphp4P59240 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nphp4P59240 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nphp4P59240 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nphp4P59240 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.2 ms