Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Csrnp3P59055 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Csrnp3P59055 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Csrnp3P59055 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Csrnp3P59055 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Csrnp3P59055 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Csrnp3P59055 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Csrnp3P59055 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Csrnp3P59055 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Csrnp3P59055 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Csrnp3P59055 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Csrnp3P59055 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Csrnp3P59055 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Csrnp3P59055 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Csrnp3P59055 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Csrnp3P59055 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Csrnp3P59055 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Csrnp3P59055 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Csrnp3P59055 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Csrnp3P59055 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Csrnp3P59055 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Csrnp3P59055 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Csrnp3P59055 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Csrnp3P59055 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Csrnp3P59055 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Csrnp3P59055 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Csrnp3P59055 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Csrnp3P59055 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Csrnp3P59055 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Csrnp3P59055 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Csrnp3P59055 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Csrnp3P59055 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Csrnp3P59055 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Csrnp3P59055 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Csrnp3P59055 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Csrnp3P59055 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Csrnp3P59055 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Csrnp3P59055 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Csrnp3P59055 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Csrnp3P59055 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Csrnp3P59055 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Csrnp3P59055 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Csrnp3P59055 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Csrnp3P59055 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Csrnp3P59055 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Csrnp3P59055 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Csrnp3P59055 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Csrnp3P59055 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Csrnp3P59055 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Csrnp3P59055 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Csrnp3P59055 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Csrnp3P59055 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Csrnp3P59055 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Csrnp3P59055 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Csrnp3P59055 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Csrnp3P59055 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Csrnp3P59055 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Csrnp3P59055 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Csrnp3P59055 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Csrnp3P59055 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Csrnp3P59055 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Csrnp3P59055 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Csrnp3P59055 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Csrnp3P59055 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Csrnp3P59055 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Csrnp3P59055 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Csrnp3P59055 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Csrnp3P59055 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Csrnp3P59055 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Csrnp3P59055 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Csrnp3P59055 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Csrnp3P59055 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Csrnp3P59055 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Csrnp3P59055 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Csrnp3P59055 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Csrnp3P59055 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Csrnp3P59055 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Csrnp3P59055 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Csrnp3P59055 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Csrnp3P59055 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Csrnp3P59055 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Csrnp3P59055 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Csrnp3P59055 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Csrnp3P59055 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Csrnp3P59055 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Csrnp3P59055 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Csrnp3P59055 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Csrnp3P59055 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Csrnp3P59055 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Csrnp3P59055 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Csrnp3P59055 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Csrnp3P59055 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Csrnp3P59055 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms