Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Samsn1P57725 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Samsn1P57725 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Samsn1P57725 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Samsn1P57725 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Samsn1P57725 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Samsn1P57725 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Samsn1P57725 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Samsn1P57725 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Samsn1P57725 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Samsn1P57725 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Samsn1P57725 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Samsn1P57725 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samsn1P57725 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samsn1P57725 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samsn1P57725 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samsn1P57725 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samsn1P57725 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samsn1P57725 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samsn1P57725 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samsn1P57725 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Samsn1P57725 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Samsn1P57725 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Samsn1P57725 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Samsn1P57725 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Samsn1P57725 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Samsn1P57725 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Samsn1P57725 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Samsn1P57725 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Samsn1P57725 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Samsn1P57725 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Samsn1P57725 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Samsn1P57725 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Samsn1P57725 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Samsn1P57725 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samsn1P57725 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samsn1P57725 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Samsn1P57725 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samsn1P57725 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samsn1P57725 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Samsn1P57725 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Samsn1P57725 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Samsn1P57725 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Samsn1P57725 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Samsn1P57725 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms