Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCBP4P57723 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCBP4P57723 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCBP4P57723 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms