Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bace1P56818 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bace1P56818 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Bace1P56818 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bace1P56818 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bace1P56818 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bace1P56818 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bace1P56818 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bace1P56818 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bace1P56818 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bace1P56818 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bace1P56818 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bace1P56818 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bace1P56818 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bace1P56818 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bace1P56818 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bace1P56818 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bace1P56818 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bace1P56818 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bace1P56818 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bace1P56818 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Bace1P56818 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Bace1P56818 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bace1P56818 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bace1P56818 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bace1P56818 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bace1P56818 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Bace1P56818 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bace1P56818 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bace1P56818 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bace1P56818 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bace1P56818 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bace1P56818 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bace1P56818 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bace1P56818 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Bace1P56818 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bace1P56818 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bace1P56818 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bace1P56818 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bace1P56818 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bace1P56818 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Bace1P56818 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bace1P56818 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bace1P56818 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bace1P56818 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bace1P56818 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Bace1P56818 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bace1P56818 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bace1P56818 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bace1P56818 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bace1P56818 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bace1P56818 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bace1P56818 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bace1P56818 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bace1P56818 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bace1P56818 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bace1P56818 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bace1P56818 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Bace1P56818 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bace1P56818 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Bace1P56818 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bace1P56818 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bace1P56818 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bace1P56818 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bace1P56818 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bace1P56818 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bace1P56818 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bace1P56818 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms