Protein–RNA interactions for Protein: P56704

WNT3A, Protein Wnt-3a, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT3AP56704 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WNT3AP56704 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WNT3AP56704 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
WNT3AP56704 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WNT3AP56704 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms