Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SOX10P56693 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SOX10P56693 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SOX10P56693 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SOX10P56693 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SOX10P56693 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SOX10P56693 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SOX10P56693 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SOX10P56693 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SOX10P56693 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SOX10P56693 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SOX10P56693 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SOX10P56693 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SOX10P56693 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SOX10P56693 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SOX10P56693 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SOX10P56693 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SOX10P56693 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SOX10P56693 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SOX10P56693 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SOX10P56693 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SOX10P56693 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SOX10P56693 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SOX10P56693 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SOX10P56693 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SOX10P56693 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SOX10P56693 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SOX10P56693 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SOX10P56693 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SOX10P56693 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SOX10P56693 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SOX10P56693 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SOX10P56693 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SOX10P56693 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SOX10P56693 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SOX10P56693 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SOX10P56693 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SOX10P56693 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SOX10P56693 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SOX10P56693 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SOX10P56693 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SOX10P56693 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SOX10P56693 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SOX10P56693 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOX10P56693 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOX10P56693 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOX10P56693 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOX10P56693 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOX10P56693 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOX10P56693 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOX10P56693 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SOX10P56693 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOX10P56693 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOX10P56693 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOX10P56693 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOX10P56693 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOX10P56693 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOX10P56693 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOX10P56693 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOX10P56693 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOX10P56693 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SOX10P56693 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SOX10P56693 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SOX10P56693 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SOX10P56693 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SOX10P56693 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SOX10P56693 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SOX10P56693 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SOX10P56693 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SOX10P56693 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SOX10P56693 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SOX10P56693 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SOX10P56693 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SOX10P56693 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SOX10P56693 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SOX10P56693 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SOX10P56693 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SOX10P56693 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SOX10P56693 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SOX10P56693 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SOX10P56693 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SOX10P56693 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SOX10P56693 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SOX10P56693 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SOX10P56693 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SOX10P56693 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SOX10P56693 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SOX10P56693 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SOX10P56693 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SOX10P56693 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SOX10P56693 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SOX10P56693 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SOX10P56693 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SOX10P56693 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SOX10P56693 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SOX10P56693 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SOX10P56693 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SOX10P56693 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SOX10P56693 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SOX10P56693 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms