Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CartptP56388 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CartptP56388 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CartptP56388 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CartptP56388 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CartptP56388 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CartptP56388 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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CartptP56388 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CartptP56388 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CartptP56388 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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CartptP56388 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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CartptP56388 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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CartptP56388 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CartptP56388 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CartptP56388 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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CartptP56388 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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CartptP56388 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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CartptP56388 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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CartptP56388 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CartptP56388 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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CartptP56388 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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CartptP56388 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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CartptP56388 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CartptP56388 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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CartptP56388 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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CartptP56388 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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CartptP56388 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CartptP56388 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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CartptP56388 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CartptP56388 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CartptP56388 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CartptP56388 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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CartptP56388 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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