Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rrp1P56183 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rrp1P56183 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rrp1P56183 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rrp1P56183 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rrp1P56183 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rrp1P56183 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rrp1P56183 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrp1P56183 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrp1P56183 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrp1P56183 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrp1P56183 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrp1P56183 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrp1P56183 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrp1P56183 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrp1P56183 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrp1P56183 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrp1P56183 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rrp1P56183 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rrp1P56183 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rrp1P56183 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rrp1P56183 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rrp1P56183 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rrp1P56183 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rrp1P56183 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rrp1P56183 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rrp1P56183 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rrp1P56183 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rrp1P56183 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rrp1P56183 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rrp1P56183 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rrp1P56183 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rrp1P56183 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms