Protein–RNA interactions for Protein: P55200

Kmt2a, Histone-lysine N-methyltransferase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 3,966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kmt2aP55200 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kmt2aP55200 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kmt2aP55200 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kmt2aP55200 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kmt2aP55200 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kmt2aP55200 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kmt2aP55200 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kmt2aP55200 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kmt2aP55200 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.3 ms