Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ELLP55199 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ELLP55199 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ELLP55199 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ELLP55199 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ELLP55199 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ELLP55199 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ELLP55199 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ELLP55199 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ELLP55199 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ELLP55199 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ELLP55199 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ELLP55199 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ELLP55199 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELLP55199 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ELLP55199 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELLP55199 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ELLP55199 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELLP55199 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELLP55199 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELLP55199 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELLP55199 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ELLP55199 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELLP55199 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELLP55199 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELLP55199 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELLP55199 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELLP55199 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELLP55199 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELLP55199 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELLP55199 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELLP55199 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELLP55199 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELLP55199 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELLP55199 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELLP55199 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELLP55199 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELLP55199 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELLP55199 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELLP55199 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ELLP55199 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ELLP55199 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ELLP55199 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ELLP55199 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ELLP55199 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ELLP55199 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ELLP55199 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ELLP55199 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ELLP55199 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ELLP55199 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ELLP55199 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ELLP55199 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ELLP55199 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ELLP55199 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ELLP55199 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ELLP55199 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ELLP55199 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ELLP55199 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ELLP55199 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ELLP55199 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ELLP55199 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ELLP55199 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ELLP55199 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ELLP55199 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ELLP55199 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ELLP55199 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ELLP55199 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ELLP55199 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ELLP55199 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ELLP55199 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ELLP55199 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ELLP55199 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ELLP55199 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ELLP55199 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ELLP55199 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ELLP55199 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ELLP55199 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ELLP55199 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ELLP55199 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ELLP55199 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ELLP55199 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ELLP55199 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ELLP55199 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ELLP55199 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ELLP55199 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ELLP55199 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ELLP55199 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ELLP55199 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ELLP55199 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ELLP55199 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ELLP55199 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ELLP55199 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ELLP55199 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ELLP55199 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ELLP55199 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ELLP55199 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ELLP55199 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ELLP55199 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ELLP55199 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ELLP55199 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 425.9 ms