Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sh3bp1P55194 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3bp1P55194 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3bp1P55194 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bp1P55194 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bp1P55194 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bp1P55194 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bp1P55194 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bp1P55194 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bp1P55194 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3bp1P55194 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3bp1P55194 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3bp1P55194 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3bp1P55194 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3bp1P55194 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp1P55194 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp1P55194 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp1P55194 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp1P55194 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp1P55194 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp1P55194 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp1P55194 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp1P55194 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp1P55194 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp1P55194 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp1P55194 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp1P55194 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3bp1P55194 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms