Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN5P54829 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms