Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
AP2S1P53680 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
AP2S1P53680 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 223 ms