Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cux1P53564 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cux1P53564 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cux1P53564 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cux1P53564 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cux1P53564 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cux1P53564 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cux1P53564 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Cux1P53564 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cux1P53564 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cux1P53564 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cux1P53564 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cux1P53564 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cux1P53564 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cux1P53564 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Cux1P53564 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cux1P53564 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cux1P53564 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Cux1P53564 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Cux1P53564 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cux1P53564 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cux1P53564 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cux1P53564 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cux1P53564 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cux1P53564 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cux1P53564 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cux1P53564 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cux1P53564 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cux1P53564 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cux1P53564 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cux1P53564 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Cux1P53564 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cux1P53564 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cux1P53564 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cux1P53564 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cux1P53564 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cux1P53564 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cux1P53564 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cux1P53564 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cux1P53564 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cux1P53564 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cux1P53564 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cux1P53564 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cux1P53564 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cux1P53564 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cux1P53564 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Cux1P53564 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cux1P53564 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cux1P53564 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cux1P53564 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cux1P53564 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cux1P53564 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cux1P53564 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cux1P53564 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cux1P53564 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Cux1P53564 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cux1P53564 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cux1P53564 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cux1P53564 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cux1P53564 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cux1P53564 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cux1P53564 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Cux1P53564 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cux1P53564 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cux1P53564 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cux1P53564 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cux1P53564 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cux1P53564 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cux1P53564 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cux1P53564 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cux1P53564 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cux1P53564 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cux1P53564 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cux1P53564 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cux1P53564 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cux1P53564 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cux1P53564 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cux1P53564 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cux1P53564 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cux1P53564 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cux1P53564 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cux1P53564 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cux1P53564 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cux1P53564 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Cux1P53564 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Cux1P53564 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Cux1P53564 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cux1P53564 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cux1P53564 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cux1P53564 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cux1P53564 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Cux1P53564 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cux1P53564 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cux1P53564 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cux1P53564 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cux1P53564 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cux1P53564 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cux1P53564 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cux1P53564 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cux1P53564 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.5 ms