Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Fgd1P52734 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fgd1P52734 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fgd1P52734 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fgd1P52734 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fgd1P52734 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fgd1P52734 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fgd1P52734 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fgd1P52734 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fgd1P52734 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fgd1P52734 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fgd1P52734 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fgd1P52734 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Fgd1P52734 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fgd1P52734 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fgd1P52734 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fgd1P52734 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fgd1P52734 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fgd1P52734 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fgd1P52734 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fgd1P52734 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fgd1P52734 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fgd1P52734 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fgd1P52734 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fgd1P52734 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fgd1P52734 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fgd1P52734 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fgd1P52734 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fgd1P52734 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fgd1P52734 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fgd1P52734 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Fgd1P52734 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fgd1P52734 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Fgd1P52734 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Fgd1P52734 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Fgd1P52734 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fgd1P52734 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fgd1P52734 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fgd1P52734 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Fgd1P52734 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fgd1P52734 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Fgd1P52734 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fgd1P52734 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fgd1P52734 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Fgd1P52734 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fgd1P52734 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fgd1P52734 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Fgd1P52734 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fgd1P52734 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fgd1P52734 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Fgd1P52734 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Fgd1P52734 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fgd1P52734 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fgd1P52734 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fgd1P52734 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Fgd1P52734 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fgd1P52734 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fgd1P52734 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fgd1P52734 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms