Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF2A2P52657 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2A2P52657 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2A2P52657 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2A2P52657 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2A2P52657 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF2A2P52657 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF2A2P52657 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF2A2P52657 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF2A2P52657 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF2A2P52657 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF2A2P52657 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF2A2P52657 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF2A2P52657 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF2A2P52657 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF2A2P52657 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF2A2P52657 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF2A2P52657 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF2A2P52657 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF2A2P52657 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF2A2P52657 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2A2P52657 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GTF2A2P52657 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms