Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERFP50548 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERFP50548 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERFP50548 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERFP50548 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERFP50548 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERFP50548 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERFP50548 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERFP50548 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERFP50548 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERFP50548 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ERFP50548 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERFP50548 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERFP50548 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERFP50548 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERFP50548 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERFP50548 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERFP50548 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ERFP50548 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERFP50548 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERFP50548 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERFP50548 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERFP50548 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERFP50548 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERFP50548 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERFP50548 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERFP50548 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERFP50548 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERFP50548 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERFP50548 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERFP50548 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERFP50548 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERFP50548 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERFP50548 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERFP50548 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERFP50548 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERFP50548 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERFP50548 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERFP50548 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERFP50548 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERFP50548 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERFP50548 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ERFP50548 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERFP50548 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERFP50548 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERFP50548 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERFP50548 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERFP50548 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERFP50548 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERFP50548 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERFP50548 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERFP50548 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERFP50548 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERFP50548 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERFP50548 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERFP50548 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERFP50548 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERFP50548 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERFP50548 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERFP50548 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERFP50548 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERFP50548 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERFP50548 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERFP50548 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERFP50548 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERFP50548 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ERFP50548 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERFP50548 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERFP50548 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERFP50548 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERFP50548 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERFP50548 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ERFP50548 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERFP50548 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERFP50548 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERFP50548 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ERFP50548 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERFP50548 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERFP50548 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERFP50548 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERFP50548 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERFP50548 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERFP50548 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERFP50548 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERFP50548 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERFP50548 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERFP50548 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERFP50548 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERFP50548 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERFP50548 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERFP50548 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERFP50548 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERFP50548 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERFP50548 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERFP50548 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERFP50548 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERFP50548 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERFP50548 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ERFP50548 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERFP50548 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.7 ms