Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brca1P48754 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brca1P48754 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brca1P48754 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brca1P48754 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brca1P48754 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Brca1P48754 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brca1P48754 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brca1P48754 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brca1P48754 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Brca1P48754 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brca1P48754 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brca1P48754 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brca1P48754 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brca1P48754 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brca1P48754 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Brca1P48754 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brca1P48754 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brca1P48754 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brca1P48754 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brca1P48754 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brca1P48754 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Brca1P48754 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brca1P48754 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brca1P48754 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brca1P48754 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brca1P48754 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brca1P48754 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Brca1P48754 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brca1P48754 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Brca1P48754 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brca1P48754 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brca1P48754 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brca1P48754 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brca1P48754 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Brca1P48754 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brca1P48754 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brca1P48754 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brca1P48754 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brca1P48754 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brca1P48754 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brca1P48754 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brca1P48754 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brca1P48754 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brca1P48754 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brca1P48754 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Brca1P48754 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Brca1P48754 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Brca1P48754 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Brca1P48754 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Brca1P48754 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Brca1P48754 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Brca1P48754 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brca1P48754 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brca1P48754 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brca1P48754 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brca1P48754 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brca1P48754 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brca1P48754 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brca1P48754 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brca1P48754 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brca1P48754 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brca1P48754 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Brca1P48754 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Brca1P48754 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brca1P48754 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brca1P48754 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brca1P48754 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Brca1P48754 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Brca1P48754 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Brca1P48754 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brca1P48754 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brca1P48754 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brca1P48754 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Brca1P48754 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Brca1P48754 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Brca1P48754 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brca1P48754 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brca1P48754 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brca1P48754 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brca1P48754 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brca1P48754 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brca1P48754 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brca1P48754 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brca1P48754 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brca1P48754 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brca1P48754 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brca1P48754 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brca1P48754 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brca1P48754 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brca1P48754 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brca1P48754 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brca1P48754 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brca1P48754 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brca1P48754 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brca1P48754 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brca1P48754 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brca1P48754 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brca1P48754 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brca1P48754 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms