Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pax9P47242 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax9P47242 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax9P47242 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax9P47242 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax9P47242 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax9P47242 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax9P47242 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax9P47242 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax9P47242 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax9P47242 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax9P47242 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax9P47242 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax9P47242 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax9P47242 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax9P47242 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pax9P47242 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax9P47242 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax9P47242 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pax9P47242 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pax9P47242 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax9P47242 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pax9P47242 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.8 ms