Protein–RNA interactions for Protein: P46737

Brcc3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brcc3P46737 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Brcc3P46737 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brcc3P46737 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Brcc3P46737 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brcc3P46737 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brcc3P46737 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brcc3P46737 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brcc3P46737 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brcc3P46737 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brcc3P46737 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brcc3P46737 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brcc3P46737 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brcc3P46737 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brcc3P46737 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brcc3P46737 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Brcc3P46737 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brcc3P46737 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brcc3P46737 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brcc3P46737 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brcc3P46737 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Brcc3P46737 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Brcc3P46737 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brcc3P46737 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brcc3P46737 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brcc3P46737 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brcc3P46737 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Brcc3P46737 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brcc3P46737 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Brcc3P46737 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brcc3P46737 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brcc3P46737 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brcc3P46737 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brcc3P46737 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Brcc3P46737 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brcc3P46737 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brcc3P46737 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brcc3P46737 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Brcc3P46737 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brcc3P46737 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brcc3P46737 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brcc3P46737 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brcc3P46737 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brcc3P46737 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brcc3P46737 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brcc3P46737 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brcc3P46737 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brcc3P46737 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brcc3P46737 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brcc3P46737 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brcc3P46737 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brcc3P46737 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brcc3P46737 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brcc3P46737 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brcc3P46737 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brcc3P46737 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brcc3P46737 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brcc3P46737 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brcc3P46737 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brcc3P46737 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Brcc3P46737 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brcc3P46737 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms