Protein–RNA interactions for Protein: P46471

Psmc2, 26S proteasome regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc2P46471 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmc2P46471 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psmc2P46471 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmc2P46471 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmc2P46471 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmc2P46471 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psmc2P46471 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmc2P46471 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmc2P46471 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psmc2P46471 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmc2P46471 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmc2P46471 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmc2P46471 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psmc2P46471 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmc2P46471 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmc2P46471 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmc2P46471 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmc2P46471 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psmc2P46471 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmc2P46471 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmc2P46471 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmc2P46471 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmc2P46471 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psmc2P46471 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psmc2P46471 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psmc2P46471 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psmc2P46471 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psmc2P46471 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmc2P46471 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmc2P46471 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmc2P46471 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmc2P46471 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmc2P46471 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmc2P46471 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmc2P46471 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Psmc2P46471 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Psmc2P46471 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmc2P46471 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms