Protein–RNA interactions for Protein: P42771

CDKN2A, Cyclin-dependent kinase inhibitor 2A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AP42771 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKN2AP42771 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDKN2AP42771 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDKN2AP42771 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms