Protein–RNA interactions for Protein: P40337

VHL, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLP40337 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VHLP40337 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VHLP40337 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VHLP40337 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VHLP40337 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VHLP40337 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VHLP40337 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VHLP40337 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VHLP40337 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VHLP40337 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VHLP40337 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VHLP40337 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VHLP40337 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VHLP40337 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VHLP40337 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VHLP40337 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VHLP40337 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VHLP40337 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VHLP40337 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VHLP40337 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VHLP40337 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VHLP40337 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VHLP40337 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VHLP40337 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VHLP40337 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VHLP40337 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VHLP40337 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VHLP40337 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VHLP40337 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VHLP40337 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VHLP40337 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VHLP40337 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VHLP40337 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VHLP40337 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VHLP40337 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VHLP40337 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VHLP40337 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VHLP40337 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VHLP40337 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VHLP40337 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VHLP40337 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VHLP40337 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VHLP40337 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VHLP40337 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VHLP40337 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VHLP40337 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VHLP40337 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VHLP40337 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VHLP40337 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VHLP40337 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VHLP40337 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VHLP40337 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VHLP40337 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VHLP40337 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VHLP40337 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VHLP40337 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VHLP40337 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VHLP40337 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VHLP40337 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VHLP40337 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VHLP40337 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VHLP40337 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VHLP40337 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VHLP40337 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VHLP40337 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VHLP40337 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VHLP40337 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VHLP40337 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VHLP40337 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VHLP40337 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VHLP40337 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VHLP40337 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VHLP40337 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VHLP40337 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VHLP40337 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VHLP40337 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VHLP40337 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VHLP40337 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VHLP40337 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VHLP40337 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VHLP40337 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VHLP40337 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VHLP40337 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VHLP40337 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VHLP40337 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VHLP40337 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VHLP40337 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VHLP40337 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VHLP40337 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VHLP40337 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VHLP40337 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VHLP40337 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VHLP40337 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VHLP40337 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VHLP40337 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VHLP40337 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VHLP40337 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VHLP40337 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VHLP40337 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VHLP40337 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms