Protein–RNA interactions for Protein: P40222

TXLNA, Alpha-taxilin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXLNAP40222 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TXLNAP40222 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TXLNAP40222 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TXLNAP40222 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TXLNAP40222 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TXLNAP40222 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TXLNAP40222 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXLNAP40222 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXLNAP40222 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXLNAP40222 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXLNAP40222 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXLNAP40222 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXLNAP40222 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXLNAP40222 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TXLNAP40222 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TXLNAP40222 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TXLNAP40222 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TXLNAP40222 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TXLNAP40222 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TXLNAP40222 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TXLNAP40222 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TXLNAP40222 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TXLNAP40222 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TXLNAP40222 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TXLNAP40222 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TXLNAP40222 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TXLNAP40222 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TXLNAP40222 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TXLNAP40222 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TXLNAP40222 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TXLNAP40222 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TXLNAP40222 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TXLNAP40222 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TXLNAP40222 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TXLNAP40222 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TXLNAP40222 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TXLNAP40222 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TXLNAP40222 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TXLNAP40222 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TXLNAP40222 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TXLNAP40222 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TXLNAP40222 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TXLNAP40222 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TXLNAP40222 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TXLNAP40222 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TXLNAP40222 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TXLNAP40222 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TXLNAP40222 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TXLNAP40222 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TXLNAP40222 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TXLNAP40222 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TXLNAP40222 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TXLNAP40222 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TXLNAP40222 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TXLNAP40222 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TXLNAP40222 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TXLNAP40222 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TXLNAP40222 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TXLNAP40222 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TXLNAP40222 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TXLNAP40222 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TXLNAP40222 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TXLNAP40222 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TXLNAP40222 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TXLNAP40222 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TXLNAP40222 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TXLNAP40222 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TXLNAP40222 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TXLNAP40222 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TXLNAP40222 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TXLNAP40222 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TXLNAP40222 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TXLNAP40222 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TXLNAP40222 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TXLNAP40222 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TXLNAP40222 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TXLNAP40222 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TXLNAP40222 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TXLNAP40222 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TXLNAP40222 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TXLNAP40222 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TXLNAP40222 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TXLNAP40222 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TXLNAP40222 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TXLNAP40222 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TXLNAP40222 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TXLNAP40222 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TXLNAP40222 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TXLNAP40222 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TXLNAP40222 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TXLNAP40222 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TXLNAP40222 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TXLNAP40222 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TXLNAP40222 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TXLNAP40222 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TXLNAP40222 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TXLNAP40222 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TXLNAP40222 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TXLNAP40222 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TXLNAP40222 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms