Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
IGHMBP2P38935 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
IGHMBP2P38935 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
IGHMBP2P38935 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IGHMBP2P38935 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IGHMBP2P38935 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IGHMBP2P38935 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
IGHMBP2P38935 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
IGHMBP2P38935 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
IGHMBP2P38935 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
IGHMBP2P38935 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
IGHMBP2P38935 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
IGHMBP2P38935 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IGHMBP2P38935 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
IGHMBP2P38935 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
IGHMBP2P38935 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
IGHMBP2P38935 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IGHMBP2P38935 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IGHMBP2P38935 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IGHMBP2P38935 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IGHMBP2P38935 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IGHMBP2P38935 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
IGHMBP2P38935 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IGHMBP2P38935 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
IGHMBP2P38935 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
IGHMBP2P38935 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IGHMBP2P38935 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
IGHMBP2P38935 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
IGHMBP2P38935 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
IGHMBP2P38935 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
IGHMBP2P38935 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
IGHMBP2P38935 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
IGHMBP2P38935 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms