Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upk2P38575 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upk2P38575 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upk2P38575 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upk2P38575 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upk2P38575 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Upk2P38575 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk2P38575 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk2P38575 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upk2P38575 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upk2P38575 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Upk2P38575 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Upk2P38575 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upk2P38575 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upk2P38575 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upk2P38575 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upk2P38575 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upk2P38575 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upk2P38575 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upk2P38575 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Upk2P38575 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Upk2P38575 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Upk2P38575 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Upk2P38575 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Upk2P38575 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Upk2P38575 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Upk2P38575 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms