Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
PtprkP35822 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PtprkP35822 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PtprkP35822 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PtprkP35822 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PtprkP35822 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PtprkP35822 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
PtprkP35822 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PtprkP35822 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PtprkP35822 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PtprkP35822 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PtprkP35822 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PtprkP35822 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PtprkP35822 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PtprkP35822 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PtprkP35822 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PtprkP35822 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PtprkP35822 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PtprkP35822 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
PtprkP35822 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PtprkP35822 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PtprkP35822 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PtprkP35822 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PtprkP35822 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PtprkP35822 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
PtprkP35822 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PtprkP35822 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PtprkP35822 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PtprkP35822 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PtprkP35822 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PtprkP35822 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PtprkP35822 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
PtprkP35822 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PtprkP35822 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PtprkP35822 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PtprkP35822 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
PtprkP35822 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PtprkP35822 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PtprkP35822 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PtprkP35822 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
PtprkP35822 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PtprkP35822 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PtprkP35822 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PtprkP35822 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PtprkP35822 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PtprkP35822 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PtprkP35822 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.29
PtprkP35822 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PtprkP35822 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
PtprkP35822 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PtprkP35822 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
PtprkP35822 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PtprkP35822 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PtprkP35822 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PtprkP35822 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PtprkP35822 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PtprkP35822 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
PtprkP35822 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
PtprkP35822 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PtprkP35822 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PtprkP35822 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PtprkP35822 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PtprkP35822 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PtprkP35822 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PtprkP35822 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PtprkP35822 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PtprkP35822 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PtprkP35822 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PtprkP35822 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
PtprkP35822 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PtprkP35822 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PtprkP35822 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PtprkP35822 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PtprkP35822 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PtprkP35822 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PtprkP35822 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PtprkP35822 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
PtprkP35822 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PtprkP35822 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PtprkP35822 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PtprkP35822 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PtprkP35822 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PtprkP35822 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PtprkP35822 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PtprkP35822 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PtprkP35822 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PtprkP35822 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PtprkP35822 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PtprkP35822 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
PtprkP35822 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
PtprkP35822 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
PtprkP35822 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PtprkP35822 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
PtprkP35822 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PtprkP35822 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PtprkP35822 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PtprkP35822 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
PtprkP35822 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PtprkP35822 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
PtprkP35822 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms