Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ly6dP35459 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ly6dP35459 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ly6dP35459 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ly6dP35459 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ly6dP35459 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ly6dP35459 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ly6dP35459 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ly6dP35459 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ly6dP35459 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ly6dP35459 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ly6dP35459 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ly6dP35459 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ly6dP35459 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ly6dP35459 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ly6dP35459 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ly6dP35459 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ly6dP35459 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ly6dP35459 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ly6dP35459 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ly6dP35459 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ly6dP35459 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ly6dP35459 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ly6dP35459 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ly6dP35459 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ly6dP35459 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ly6dP35459 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ly6dP35459 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ly6dP35459 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ly6dP35459 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ly6dP35459 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ly6dP35459 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ly6dP35459 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ly6dP35459 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ly6dP35459 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ly6dP35459 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ly6dP35459 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ly6dP35459 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ly6dP35459 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ly6dP35459 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ly6dP35459 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ly6dP35459 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ly6dP35459 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ly6dP35459 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ly6dP35459 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ly6dP35459 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ly6dP35459 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ly6dP35459 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ly6dP35459 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ly6dP35459 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ly6dP35459 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ly6dP35459 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ly6dP35459 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ly6dP35459 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ly6dP35459 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ly6dP35459 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ly6dP35459 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ly6dP35459 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ly6dP35459 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ly6dP35459 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ly6dP35459 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ly6dP35459 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ly6dP35459 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ly6dP35459 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ly6dP35459 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ly6dP35459 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ly6dP35459 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ly6dP35459 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ly6dP35459 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ly6dP35459 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ly6dP35459 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ly6dP35459 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ly6dP35459 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ly6dP35459 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ly6dP35459 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ly6dP35459 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ly6dP35459 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ly6dP35459 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ly6dP35459 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ly6dP35459 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ly6dP35459 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ly6dP35459 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ly6dP35459 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ly6dP35459 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ly6dP35459 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ly6dP35459 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ly6dP35459 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ly6dP35459 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ly6dP35459 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ly6dP35459 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ly6dP35459 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ly6dP35459 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ly6dP35459 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ly6dP35459 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ly6dP35459 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ly6dP35459 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ly6dP35459 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ly6dP35459 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ly6dP35459 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ly6dP35459 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms