Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN7P35236 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPN7P35236 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPN7P35236 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN7P35236 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN7P35236 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN7P35236 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN7P35236 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN7P35236 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN7P35236 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN7P35236 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN7P35236 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN7P35236 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN7P35236 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN7P35236 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN7P35236 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN7P35236 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN7P35236 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN7P35236 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN7P35236 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN7P35236 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN7P35236 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN7P35236 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN7P35236 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN7P35236 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN7P35236 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN7P35236 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN7P35236 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN7P35236 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN7P35236 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN7P35236 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN7P35236 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN7P35236 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN7P35236 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN7P35236 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms