Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ptpn11P35235 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ptpn11P35235 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ptpn11P35235 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ptpn11P35235 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ptpn11P35235 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ptpn11P35235 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ptpn11P35235 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptpn11P35235 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptpn11P35235 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptpn11P35235 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptpn11P35235 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptpn11P35235 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptpn11P35235 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ptpn11P35235 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ptpn11P35235 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ptpn11P35235 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ptpn11P35235 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ptpn11P35235 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpn11P35235 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpn11P35235 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpn11P35235 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpn11P35235 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpn11P35235 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpn11P35235 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpn11P35235 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptpn11P35235 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptpn11P35235 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptpn11P35235 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpn11P35235 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpn11P35235 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpn11P35235 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpn11P35235 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpn11P35235 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpn11P35235 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpn11P35235 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpn11P35235 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpn11P35235 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ptpn11P35235 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ptpn11P35235 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptpn11P35235 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptpn11P35235 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptpn11P35235 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptpn11P35235 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptpn11P35235 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptpn11P35235 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptpn11P35235 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptpn11P35235 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ptpn11P35235 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpn11P35235 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpn11P35235 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpn11P35235 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpn11P35235 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpn11P35235 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpn11P35235 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ptpn11P35235 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Ptpn11P35235 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ptpn11P35235 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptpn11P35235 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptpn11P35235 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptpn11P35235 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptpn11P35235 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptpn11P35235 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptpn11P35235 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptpn11P35235 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptpn11P35235 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptpn11P35235 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptpn11P35235 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptpn11P35235 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpn11P35235 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpn11P35235 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpn11P35235 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpn11P35235 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpn11P35235 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpn11P35235 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpn11P35235 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ptpn11P35235 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ptpn11P35235 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpn11P35235 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpn11P35235 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpn11P35235 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpn11P35235 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpn11P35235 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ptpn11P35235 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ptpn11P35235 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ptpn11P35235 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ptpn11P35235 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ptpn11P35235 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ptpn11P35235 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ptpn11P35235 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ptpn11P35235 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptpn11P35235 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptpn11P35235 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptpn11P35235 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptpn11P35235 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptpn11P35235 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptpn11P35235 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptpn11P35235 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptpn11P35235 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptpn11P35235 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms