Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Apoc3P33622 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apoc3P33622 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apoc3P33622 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apoc3P33622 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apoc3P33622 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms