Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA13P31271 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA13P31271 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HOXA13P31271 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HOXA13P31271 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HOXA13P31271 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HOXA13P31271 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXA13P31271 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXA13P31271 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HOXA13P31271 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HOXA13P31271 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HOXA13P31271 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXA13P31271 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXA13P31271 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXA13P31271 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXA13P31271 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HOXA13P31271 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HOXA13P31271 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
HOXA13P31271 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HOXA13P31271 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HOXA13P31271 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HOXA13P31271 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HOXA13P31271 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HOXA13P31271 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HOXA13P31271 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXA13P31271 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXA13P31271 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXA13P31271 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOXA13P31271 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXA13P31271 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXA13P31271 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXA13P31271 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXA13P31271 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXA13P31271 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXA13P31271 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXA13P31271 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXA13P31271 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXA13P31271 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXA13P31271 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXA13P31271 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXA13P31271 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXA13P31271 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXA13P31271 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXA13P31271 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXA13P31271 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXA13P31271 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXA13P31271 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXA13P31271 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXA13P31271 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXA13P31271 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HOXA13P31271 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXA13P31271 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HOXA13P31271 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXA13P31271 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXA13P31271 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXA13P31271 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXA13P31271 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXA13P31271 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXA13P31271 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXA13P31271 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXA13P31271 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms