Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA9P31269 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA9P31269 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA9P31269 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA9P31269 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA9P31269 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA9P31269 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA9P31269 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA9P31269 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA9P31269 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA9P31269 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA9P31269 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA9P31269 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA9P31269 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA9P31269 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA9P31269 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA9P31269 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA9P31269 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA9P31269 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA9P31269 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA9P31269 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA9P31269 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA9P31269 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA9P31269 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA9P31269 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA9P31269 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms