Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctnnd1P30999 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctnnd1P30999 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctnnd1P30999 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctnnd1P30999 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctnnd1P30999 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctnnd1P30999 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctnnd1P30999 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnnd1P30999 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnnd1P30999 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnnd1P30999 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnnd1P30999 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnnd1P30999 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnnd1P30999 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnnd1P30999 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnnd1P30999 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnnd1P30999 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnnd1P30999 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnnd1P30999 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnnd1P30999 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnnd1P30999 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnnd1P30999 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnnd1P30999 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnnd1P30999 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnnd1P30999 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnnd1P30999 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnnd1P30999 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnnd1P30999 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnnd1P30999 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnnd1P30999 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnnd1P30999 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnnd1P30999 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnnd1P30999 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnnd1P30999 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnnd1P30999 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnnd1P30999 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.1 ms