Protein–RNA interactions for Protein: P30041

PRDX6, Peroxiredoxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX6P30041 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDX6P30041 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDX6P30041 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDX6P30041 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms