Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Casp1P29452 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Casp1P29452 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Casp1P29452 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Casp1P29452 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Casp1P29452 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Casp1P29452 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Casp1P29452 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Casp1P29452 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Casp1P29452 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Casp1P29452 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Casp1P29452 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Casp1P29452 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Casp1P29452 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Casp1P29452 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Casp1P29452 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Casp1P29452 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Casp1P29452 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Casp1P29452 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Casp1P29452 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Casp1P29452 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Casp1P29452 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Casp1P29452 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Casp1P29452 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Casp1P29452 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Casp1P29452 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Casp1P29452 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Casp1P29452 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Casp1P29452 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Casp1P29452 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Casp1P29452 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Casp1P29452 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Casp1P29452 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Casp1P29452 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Casp1P29452 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Casp1P29452 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Casp1P29452 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Casp1P29452 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Casp1P29452 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Casp1P29452 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Casp1P29452 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Casp1P29452 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Casp1P29452 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Casp1P29452 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Casp1P29452 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Casp1P29452 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Casp1P29452 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Casp1P29452 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Casp1P29452 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Casp1P29452 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Casp1P29452 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Casp1P29452 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Casp1P29452 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Casp1P29452 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Casp1P29452 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Casp1P29452 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Casp1P29452 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Casp1P29452 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Casp1P29452 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Casp1P29452 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Casp1P29452 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Casp1P29452 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Casp1P29452 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Casp1P29452 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Casp1P29452 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Casp1P29452 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Casp1P29452 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Casp1P29452 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Casp1P29452 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Casp1P29452 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Casp1P29452 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Casp1P29452 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Casp1P29452 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms