Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHA3P29320 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHA3P29320 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHA3P29320 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms