Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kif5cP28738 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kif5cP28738 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kif5cP28738 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kif5cP28738 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kif5cP28738 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Kif5cP28738 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kif5cP28738 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kif5cP28738 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Kif5cP28738 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kif5cP28738 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kif5cP28738 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kif5cP28738 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kif5cP28738 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kif5cP28738 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kif5cP28738 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kif5cP28738 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kif5cP28738 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kif5cP28738 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kif5cP28738 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kif5cP28738 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kif5cP28738 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kif5cP28738 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kif5cP28738 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kif5cP28738 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kif5cP28738 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kif5cP28738 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kif5cP28738 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Kif5cP28738 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kif5cP28738 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kif5cP28738 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kif5cP28738 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kif5cP28738 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kif5cP28738 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kif5cP28738 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kif5cP28738 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kif5cP28738 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kif5cP28738 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kif5cP28738 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kif5cP28738 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kif5cP28738 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kif5cP28738 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kif5cP28738 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kif5cP28738 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kif5cP28738 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kif5cP28738 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kif5cP28738 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kif5cP28738 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kif5cP28738 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kif5cP28738 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kif5cP28738 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kif5cP28738 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kif5cP28738 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kif5cP28738 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kif5cP28738 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kif5cP28738 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kif5cP28738 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kif5cP28738 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kif5cP28738 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kif5cP28738 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kif5cP28738 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms