Protein–RNA interactions for Protein: P28575

Ipp, Actin-binding protein IPP, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IppP28575 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IppP28575 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IppP28575 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IppP28575 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IppP28575 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IppP28575 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IppP28575 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IppP28575 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IppP28575 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
IppP28575 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IppP28575 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IppP28575 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IppP28575 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IppP28575 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IppP28575 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IppP28575 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IppP28575 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IppP28575 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IppP28575 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IppP28575 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IppP28575 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IppP28575 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IppP28575 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IppP28575 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IppP28575 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IppP28575 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IppP28575 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IppP28575 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IppP28575 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IppP28575 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IppP28575 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IppP28575 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IppP28575 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IppP28575 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IppP28575 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IppP28575 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IppP28575 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IppP28575 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
IppP28575 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
IppP28575 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IppP28575 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IppP28575 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IppP28575 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IppP28575 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IppP28575 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IppP28575 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IppP28575 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IppP28575 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IppP28575 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IppP28575 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IppP28575 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IppP28575 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IppP28575 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IppP28575 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IppP28575 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IppP28575 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IppP28575 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IppP28575 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IppP28575 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IppP28575 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IppP28575 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IppP28575 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IppP28575 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IppP28575 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IppP28575 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IppP28575 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IppP28575 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IppP28575 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IppP28575 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IppP28575 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IppP28575 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IppP28575 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IppP28575 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IppP28575 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
IppP28575 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IppP28575 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IppP28575 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IppP28575 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IppP28575 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IppP28575 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IppP28575 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IppP28575 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IppP28575 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IppP28575 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IppP28575 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IppP28575 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IppP28575 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IppP28575 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IppP28575 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IppP28575 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IppP28575 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IppP28575 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IppP28575 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IppP28575 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IppP28575 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IppP28575 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IppP28575 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IppP28575 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IppP28575 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IppP28575 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.5 ms