Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMB9P28065 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB9P28065 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB9P28065 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms