Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN3P26045 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN3P26045 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN3P26045 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN3P26045 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN3P26045 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN3P26045 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN3P26045 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN3P26045 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN3P26045 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN3P26045 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN3P26045 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN3P26045 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN3P26045 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN3P26045 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN3P26045 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN3P26045 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN3P26045 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN3P26045 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN3P26045 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN3P26045 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN3P26045 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN3P26045 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN3P26045 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN3P26045 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN3P26045 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN3P26045 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN3P26045 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN3P26045 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN3P26045 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN3P26045 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN3P26045 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPN3P26045 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPN3P26045 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms