Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RdxP26043 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RdxP26043 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RdxP26043 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RdxP26043 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RdxP26043 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RdxP26043 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RdxP26043 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RdxP26043 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RdxP26043 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RdxP26043 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RdxP26043 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RdxP26043 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RdxP26043 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RdxP26043 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RdxP26043 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RdxP26043 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RdxP26043 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RdxP26043 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RdxP26043 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RdxP26043 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RdxP26043 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RdxP26043 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RdxP26043 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RdxP26043 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RdxP26043 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RdxP26043 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RdxP26043 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RdxP26043 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RdxP26043 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RdxP26043 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RdxP26043 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RdxP26043 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RdxP26043 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RdxP26043 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RdxP26043 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RdxP26043 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RdxP26043 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RdxP26043 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RdxP26043 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RdxP26043 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RdxP26043 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RdxP26043 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RdxP26043 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RdxP26043 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RdxP26043 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RdxP26043 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RdxP26043 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RdxP26043 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RdxP26043 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RdxP26043 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RdxP26043 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RdxP26043 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RdxP26043 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RdxP26043 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RdxP26043 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RdxP26043 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RdxP26043 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RdxP26043 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RdxP26043 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RdxP26043 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RdxP26043 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RdxP26043 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RdxP26043 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RdxP26043 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RdxP26043 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RdxP26043 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RdxP26043 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RdxP26043 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RdxP26043 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RdxP26043 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RdxP26043 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RdxP26043 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RdxP26043 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RdxP26043 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RdxP26043 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RdxP26043 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RdxP26043 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RdxP26043 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RdxP26043 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RdxP26043 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RdxP26043 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RdxP26043 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RdxP26043 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RdxP26043 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RdxP26043 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RdxP26043 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RdxP26043 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RdxP26043 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RdxP26043 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RdxP26043 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RdxP26043 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RdxP26043 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RdxP26043 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RdxP26043 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RdxP26043 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RdxP26043 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RdxP26043 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RdxP26043 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RdxP26043 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms