Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM3P25205 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM3P25205 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM3P25205 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM3P25205 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM3P25205 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM3P25205 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM3P25205 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM3P25205 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM3P25205 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM3P25205 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM3P25205 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM3P25205 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM3P25205 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM3P25205 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM3P25205 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM3P25205 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM3P25205 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM3P25205 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM3P25205 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM3P25205 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM3P25205 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM3P25205 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM3P25205 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM3P25205 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM3P25205 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM3P25205 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM3P25205 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM3P25205 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM3P25205 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM3P25205 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM3P25205 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM3P25205 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM3P25205 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM3P25205 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM3P25205 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM3P25205 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM3P25205 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM3P25205 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM3P25205 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM3P25205 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM3P25205 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM3P25205 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM3P25205 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCM3P25205 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCM3P25205 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCM3P25205 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCM3P25205 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCM3P25205 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCM3P25205 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCM3P25205 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCM3P25205 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCM3P25205 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCM3P25205 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCM3P25205 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCM3P25205 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCM3P25205 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCM3P25205 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCM3P25205 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCM3P25205 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCM3P25205 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCM3P25205 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCM3P25205 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCM3P25205 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MCM3P25205 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCM3P25205 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCM3P25205 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCM3P25205 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCM3P25205 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCM3P25205 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCM3P25205 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCM3P25205 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCM3P25205 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCM3P25205 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCM3P25205 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCM3P25205 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCM3P25205 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCM3P25205 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCM3P25205 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MCM3P25205 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCM3P25205 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MCM3P25205 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCM3P25205 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCM3P25205 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCM3P25205 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCM3P25205 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCM3P25205 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCM3P25205 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCM3P25205 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MCM3P25205 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCM3P25205 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCM3P25205 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCM3P25205 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCM3P25205 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCM3P25205 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCM3P25205 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCM3P25205 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCM3P25205 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCM3P25205 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCM3P25205 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms